Flugzeug: Inlandsflüge sind relativ preisgünstig und sparen einige Zeit gegenüber dem Transportmitteln auf dem Land. Die Fluglinien SAMI, Atlantik, Sosa und Islena bieten Inlandsflüge an.
Es gibt mindestens drei tägliche Flüge nach Roatan, weniger nach Utila und Guanaja. Man kann auch nach La Moskitia fliegen.
Die meisten Flüge starten in San Pedro. Es gibt in Honduras mehr als 30 Flugplätze. Auch abgelegene Gebiete werden regelmäßig von Kleinflugzeugen bedient.

 

Schiff: auf La Moskitia sind Boote fast das einzige Verkehrsmittel zwischen den Städten und über die Lagune, u.a. kommt man mit ihnen bis nach Las Marías, wo eine Reihe von beliebten Touren beginnt.

Auf Roatan sind Wassertaxis sind der beste Weg, um von West End nach West Bay zu kommen. Auch zur Isla El Tigre im südlichen Honduras gelangt man mit Motorbooten (Lanchas).

 

Zwei bequeme, klimatisierte Passagierfähren, Utila Princess und MV Galaxy II, fahren nach Roatan und Utila. Es gibt keine direkte Verbindung zwischen den beiden Inseln – Sie müssen über La Ceiba reisen. Es gibt auch keinen Fährverkehr nach Guanaja.

 

Zug: die drei Bahnstrecken im nördlichen Landesteil werden hauptsächlich für den Bananentransport genutzt. Es ist möglich, auf dem Bananenzug aus San Pedro Sula mitzureisen, in La Ceiba gibt es einen Touristenzug.

Auto: das Straßennetz in Honduras hat eine Länge von etwa 14.600 km, nur etwas mehr als 2543 km sind asphaltiert, etwa die Hälfte ist mit Schotter bedeckt. Wetterfeste Straßen verbinden Tegucigalpa mit San Pedro Sula, Puerto Cortés, La Ceiba und den grössten Städten an der karibischen Küste und am Golfo de Fonseca. In der Dunkelheit sollte man nicht fahren. Abseits der befestigten Strassen werden Geländewagen empfohlen. Mietwagen sind in allen großen Städten und auf Roatan erhältlich. Die Preise für Kleinwagen beginnen bei 30 US-dollar pro Tag, am Flughafen liegen die Preise 10 – 15 % höher.
Zu den Mietagenturen in Honduras gehören: Avis, Hertz, Advance Rent A Car, Arena Rent a Car, Caribbean Rent a Car, Budget, National/Alamo, Econo Rent-a-Car und  Molinari Rent A Car.

Busse sind eine gute und billige Möglichkeit, in Honduras zu reisen. Normalerweise starten die Busse sehr früh am Morgen, am späten Nachmittag kann man kaum noch eine Busverbindung finden. Auf einigen Strecken fahren Mikrobusse oder rapiditos (Minivans). Sie sind allgemein schneller und fahren häufiger als normale Busse.

 

Reservierungen für Busverbindungen sind in der Regel nicht erforderlich. Für Reisen während der Semana Santa (die Woche vor Ostern) sollten Sie Ihr Ticket jedoch ein oder zwei Tage im Voraus kaufen.

Es wird dringend empfohlen, dass Besucher in Honduras keine Stadtbusse nutzen, vor allem in San Pedro Sula und Tegucigalpa. Neben Taschendiebstahl besteht die Gefahr, dass die Busse in bestimmten Stadtvierteln von Banden angehalten werden, um eine "Maut" zu verlangen.
Die Taxipreise sind so günstig, dass sich das Risiko nicht lohnt.

Taxis in Honduras haben kein Taxameter, in den meisten Städten gibt es aber feste Tarife. In vielen Städten befahren colectivos (Sammeltaxis) mehrere feste Routen. Einigen Sie sich in jedem Fall vor der Abfahrt mit dem Fahrer über den Preis.